Alytaus regiono aplinkos apsaugos departamento Valstybinės analitinės kontrolės skyrius pilnai įvykdė ežerų ir upių valstybinių monitoringų planus. Pagal Paviršinių vandens telkinių būklės nustatymo metodiką (Žin., 2010, Nr. 29 - 1363), upių ir ežerų ekologinė būklė yra vertinama pagal fizikinius – cheminius, hidromorfologinius ir biologinius kokybės elementus. Valstybinės analitinės kontrolės skyrius tyrė upių ir ežerų fizikinius – cheminius kokybės elementus. Juos įvertinus, labai gerai ekologinės būklės klasei galima priskirti 5 ežerus, gerai – 9 ežerus ir 6 upes, vidutinei – 1 ežerą ir 1 upę (2 tyrimų vietose), l. blogai – 1 ežerą.
| Agentūra | Ekologinės būklės klasė | |||||
| Labai gera | Gera | Vidutinė | Bloga | Labai bloga | ||
| Alytaus raj. | Upės | Nemunas | ||||
| Ežerai | Obelija, Gailintas | Didžiulis, Kavalys, Luksnėnų | Gudelių | Atesys | ||
| Lazdijų raj. | Upės | Baltoji Ančia | ||||
| Ežerai | Snaigynas | Vilkinys, Sagavas , Zapsys, Veisiejis | ||||
| Druskininkų | Upės | Nemunas | ||||
| Ežerai | Aviris | |||||
| Prienų raj. | Upės | Verknė | ||||
| Ežerai | ||||||
| Varėnos raj. | Upės | Merkys, Skroblus, Ūla-Pelesa, Verseka | ||||
| Ežerai | Savistas | Glūkas, Ilgis | ||||
Lietuvos Respublikos aplinkos ministerijos informacija